Именно так собаки и переносят щенков с места на место - беря их поперек. Собаки не берут щенков за шкирку, а именно поперек.
Но таскать новорожденных щенков по дому не самое лучшее, что для них нужно. Видимо сука неопытная и очень к вам привязаная. Она наверное и раньше ходила везде с вами, и теперь просто разрывается между щенками и вами. И пытается "совместить"
Может быть ищет более лучшее и безопасное для щенят место и её не устраивает то что есть.Если честно, я бы сделала ей вольерчик, и поместила туда вместе со щенками, чтобы у неё не было возможности таскать их и бегать по всему дому.
Но у меня обычно обратная пробемма - первые дни собаки не отходят от детей ни на шаг и вывести их в туалет приходится силой. И никуда они их не таскают, т.к. обустроенное место их устраивает.
.Говорю Вам как бабуля 
